Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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