Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms