Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GcaQ8VC88 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GcaQ8VC88 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms