Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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Vmn1r200Q8R281 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Vmn1r200Q8R281 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
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