Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd3Q8R1N4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd3Q8R1N4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms