Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms