Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7N6

Traf3ip2, TRAF3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip2Q8N7N6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip2Q8N7N6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip2Q8N7N6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms