Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw1Q8K4P8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw1Q8K4P8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms