Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms