Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms