Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cmc2Q8K199 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms