Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FgbQ8K0E8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms