Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf628Q8CJ78 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Znf628Q8CJ78 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Znf628Q8CJ78 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Znf628Q8CJ78 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf628Q8CJ78 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf628Q8CJ78 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf628Q8CJ78 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf628Q8CJ78 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf628Q8CJ78 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms