Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms