Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E4f1Q8CCE9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E4f1Q8CCE9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms