Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms