Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms