Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc187Q8C5V8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc187Q8C5V8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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