Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3Q9

Casp9, Caspase-9, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp9Q8C3Q9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp9Q8C3Q9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms