Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a2Q8BY89 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a2Q8BY89 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a2Q8BY89 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a2Q8BY89 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a2Q8BY89 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a2Q8BY89 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a2Q8BY89 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a2Q8BY89 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms