Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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