Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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