Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp43Q8BUM9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usp43Q8BUM9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp43Q8BUM9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp43Q8BUM9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp43Q8BUM9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp43Q8BUM9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp43Q8BUM9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp43Q8BUM9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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