Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms