Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rccd1Q8BTU7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms