Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup54Q8BTS4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms