Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Prpf18Q8BM39 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prpf18Q8BM39 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prpf18Q8BM39 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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