Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLE7

Slc17a6, Vesicular glutamate transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a6Q8BLE7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc17a6Q8BLE7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms