Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c2Q8BL74 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c2Q8BL74 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms