Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms