Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubash3bQ8BGG7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms