Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpped1Q8BFS6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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