Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms