Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IfneQ80ZF2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms