Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pnma8aQ80VM8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pnma8aQ80VM8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pnma8aQ80VM8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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