Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccp110Q7TSH4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms