Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms