Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms