Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actn1Q7TPR4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms