Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn4bQ7M729 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scn4bQ7M729 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms