Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms