Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme8Q715T0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms