Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Syne2Q6ZWQ0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms