Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd4Q6ZPR5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms