Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ssxb10Q6XAR7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ssxb10Q6XAR7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ssxb10Q6XAR7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ssxb10Q6XAR7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ssxb10Q6XAR7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ssxb10Q6XAR7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssxb10Q6XAR7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Ssxb10Q6XAR7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ssxb10Q6XAR7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb10Q6XAR7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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