Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

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Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp2b4Q6Q477 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp2b4Q6Q477 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp2b4Q6Q477 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Atp2b4Q6Q477 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Atp2b4Q6Q477 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Atp2b4Q6Q477 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Atp2b4Q6Q477 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Atp2b4Q6Q477 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Atp2b4Q6Q477 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Atp2b4Q6Q477 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b4Q6Q477 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms