Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFC5

Lrit2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit2Q6PFC5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrit2Q6PFC5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit2Q6PFC5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms