Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtifQ6PEE2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms