Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms