Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms